Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH1Q15438 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH1Q15438 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms