Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
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