Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms