Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms