Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms