Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms