Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms