Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms