Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

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Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIP1O00291 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIP1O00291 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIP1O00291 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIP1O00291 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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