Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms