Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms