Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms