Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms