Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms