Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms