Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms