Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms