Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms