Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms