Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms