Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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