Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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