Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RABEP1Q15276 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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RABEP1Q15276 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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RABEP1Q15276 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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RABEP1Q15276 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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RABEP1Q15276 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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