Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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