Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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IRF5Q13568 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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IRF5Q13568 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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IRF5Q13568 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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