Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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