Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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