Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CNTN1Q12860 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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CNTN1Q12860 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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CNTN1Q12860 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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CNTN1Q12860 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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