Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB1Q02818 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms