Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXP28300 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXP28300 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms