Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms