Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms