Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFL1O94874 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms