Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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