Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RARRES3Q9UL19 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms