Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms