Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms