Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms