Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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FOXQ1Q9C009 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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FOXQ1Q9C009 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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FOXQ1Q9C009 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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