Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf50Q9BV19 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms