Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD4Q96M96 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms