Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms