Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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