Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHIPQ8WWQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHIPQ8WWQ0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHIPQ8WWQ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHIPQ8WWQ0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms