Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms