Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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