Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP4Q8N2S1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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