Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD6Q6ZSS7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms