Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms