Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE3Q6ZMZ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms